Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP15Q9Y4E8 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms