Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TTF2Q9UNY4 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms