Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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ZNF346Q9UL40 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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ZNF346Q9UL40 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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ZNF346Q9UL40 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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