Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DSEQ9UL01 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms