Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TUBE1Q9UJT0 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms