Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA3Q9UI47 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms