Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF2Q9UG63 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms