Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM8A1Q9UBU6 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms