Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms