Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REREQ9P2R6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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