Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
KLHL28Q9NXS3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms