Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SERINC1Q9NRX5 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms