Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms