Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-5Q9HDB9 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms