Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GOPCQ9HD26 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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