Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00597Q9H2U6 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms