Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BCO2Q9BYV7 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms