Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRIM54Q9BYV2 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms