Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 GHRH-203ENST00000373614 570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 UGT2B29P-201ENST00000509021 973 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF331-218ENST00000513265 739 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 CBR3-AS1-213ENST00000623647 815 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-8Q9BYQ0 MTRNR2L4-201ENST00000399974 1762 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms