Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms