Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NICN1Q9BSH3 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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