Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 POPDC2-208ENST00000493094 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 GPD1-201ENST00000301149 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 BHMT2-201ENST00000255192 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 A1CF-203ENST00000373995 2211 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 CPA5-208ENST00000485477 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 AC026797.1-201ENST00000624837 2869 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C2orf88Q9BSF0 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 TRHDE-AS1-202ENST00000435350 2966 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 SLC45A2-202ENST00000382102 2723 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 PNPO-217ENST00000642017 3465 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms