Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 AC068631.1-255ENST00000608173 588 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SGIP1Q9BQI5 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGIP1Q9BQI5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms