Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPS8Q99627 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS8Q99627 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS8Q99627 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 243.4 ms