Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBGCP5Q96RT8 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms