Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms