Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SMIM12Q96EX1 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms