Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBE2E3Q969T4 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms