Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3LQ8TDB6 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3LQ8TDB6 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3LQ8TDB6 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3LQ8TDB6 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3LQ8TDB6 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3LQ8TDB6 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3LQ8TDB6 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3LQ8TDB6 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3LQ8TDB6 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3LQ8TDB6 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3LQ8TDB6 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3LQ8TDB6 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3LQ8TDB6 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3LQ8TDB6 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3LQ8TDB6 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3LQ8TDB6 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3LQ8TDB6 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3LQ8TDB6 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3LQ8TDB6 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3LQ8TDB6 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3LQ8TDB6 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3LQ8TDB6 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3LQ8TDB6 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3LQ8TDB6 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3LQ8TDB6 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DTX3LQ8TDB6 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DTX3LQ8TDB6 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DTX3LQ8TDB6 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DTX3LQ8TDB6 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DTX3LQ8TDB6 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
DTX3LQ8TDB6 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
DTX3LQ8TDB6 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
DTX3LQ8TDB6 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
DTX3LQ8TDB6 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DTX3LQ8TDB6 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX3LQ8TDB6 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms