Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC90

CCER1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER1Q8TC90 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCER1Q8TC90 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCER1Q8TC90 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCER1Q8TC90 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCER1Q8TC90 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER1Q8TC90 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms