Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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TTC29Q8NA56 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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TTC29Q8NA56 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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TTC29Q8NA56 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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TTC29Q8NA56 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TTC29Q8NA56 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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