Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms