Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms