Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM48Q8IWZ4 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms