Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTOP1Q7RTM1 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms