Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms