Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 PUM2-203ENST00000361078 6251 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 DNM3-208ENST00000627582 7625 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
HRCT1Q6UXD1 ADNP-203ENST00000396029 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 SMIM10L1-201ENST00000622602 4795 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 CDH4-203ENST00000614565 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 EIF3L-214ENST00000624234 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 LRCH1-203ENST00000389798 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
HRCT1Q6UXD1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms