Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 TXN2-201ENST00000216185 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 LINC00893-215ENST00000618757 2347 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AL356488.3-201ENST00000608574 2888 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 TPX2-202ENST00000340513 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
C16orf54Q6UWD8 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms