Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms