Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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C9orf135Q5VTT2 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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C9orf135Q5VTT2 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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C9orf135Q5VTT2 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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C9orf135Q5VTT2 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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C9orf135Q5VTT2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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C9orf135Q5VTT2 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf135Q5VTT2 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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