Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNA2D3-AS1-201ENST00000471265 2078 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC00662-206ENST00000590523 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 SLA2-201ENST00000262866 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 CELF3-202ENST00000290585 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGEF4-212ENST00000525839 3828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 EPB41L5-201ENST00000263713 6628 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 NLRP2-208ENST00000448584 3573 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 SEC31A-202ENST00000311785 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 COL4A6-209ENST00000545689 6380 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF473-203ENST00000445728 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF75D-202ENST00000370766 5592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 NRXN1-233ENST00000630543 4500 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 PRKN-206ENST00000366898 4180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAMTS9-210ENST00000498707 7624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 PLAU-201ENST00000372764 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 DCAF16-201ENST00000382247 4548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 MRVI1-209ENST00000531107 2887 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01428-201ENST00000449581 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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COL5A1-AS1Q5SY13 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 ZIK1-202ENST00000536878 4144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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COL5A1-AS1Q5SY13 GDPD5-202ENST00000443276 3106 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 PKP4P1-201ENST00000426801 2158 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 POLL-203ENST00000370162 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 TIAM1-206ENST00000541036 7018 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 ST5-201ENST00000313726 4507 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 BCL9-201ENST00000234739 6278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 EPB42-202ENST00000441366 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 AHI1-205ENST00000457866 5549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 ELMOD3-202ENST00000393852 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 IKZF4-201ENST00000262032 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 POLR3E-219ENST00000615879 3655 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 P4HA1-201ENST00000263556 2844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 P4HA1-204ENST00000394890 2844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
COL5A1-AS1Q5SY13 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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