Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms