Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms