Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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