Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NTRK3Q16288 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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