Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS72Q15906 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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