Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
USF2Q15853 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
USF2Q15853 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms