Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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