Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR1D2Q14995 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms