Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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COL19A1Q14993 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL19A1Q14993 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL19A1Q14993 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL19A1Q14993 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL19A1Q14993 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL19A1Q14993 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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COL19A1Q14993 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL19A1Q14993 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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COL19A1Q14993 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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COL19A1Q14993 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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COL19A1Q14993 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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COL19A1Q14993 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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COL19A1Q14993 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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COL19A1Q14993 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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COL19A1Q14993 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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COL19A1Q14993 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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COL19A1Q14993 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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COL19A1Q14993 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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COL19A1Q14993 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COL19A1Q14993 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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